En el informe elaborado por CHA se incluyen 17 alegaciones contra el estudio de impacto ambiental del PHN. A juicio de Chunta Aragonesista, el estudio debía incluir un resumen comprensible para cualquier ciudadano, pero el documento de síntesis "no está detallado y es difícil de entender". Además, el partido nacionalista considera que se han producido "grandes dificultades" en el acceso a la información del estudio y que el caudal ecológico mínimo de cien metros cúbicos por segundo para la zona de la desembocadura del Ebro no cumple los mínimos para conservar las condiciones del río ni del delta. Las alegaciones también se refieren al posible deterioro de la calidad del agua y a la imposibilidad de que desde el Ebro se puedan extraer 1.050 hectómetros cúbicos anuales. Asimismo, el informe explica, entre otros problemas, la falta de detalles sobre la sostenibilidad de la agricultura en las zonas afectadas y sobre el intercambio de especies animales entre ríos.