Con la entrada en vigor de los planes de estudios previstos en la LOGSE, el Conservatorio Superior de Música de Zaragoza imparte ya 28 especialidades. De ellas, 22 son instrumentales. Se trata de acordeón, arpa, clarinete, clavecín, contrabajo, fagot, flauta de pico, flauta travesera, guitarra, instrumentos de púa, oboe, órgano, percusión, piano, saxofón, trombón, trompa, trompeta, tuba, viola, violín y violonchelo.

Además, están implantadas en el centro zaragozano otras 6 especialidades teórico-prácticas: composición, dirección de coros, dirección de orquesta, etnomusicología, musicología, pedagogía del lenguaje y de la educación musical.