Las principales líneas de investigación son el diagnóstico y confirmación de la encefalopatía espongiforme bovina y de los casos de enfermedad de Scrapie en ovinos y caprinos, contraste de nuevas técnicas de diagnóstico, tipificación de las cepas responsables del Scrapie, genotipado del gen priónico en el ganado ovino y caprino, elaboración de programas formativos para sectores profesionales directamente implicados en la enfermedad y creación de una base de datos informativa sobre estas patologías que sirva de asesoramiento a las autoridades y de información tanto a los consumidores como a los productores y a los medios de comunicación.