En opinión de Medio Ambiente de la UE, "no es posible determinar de cuánta agua es probable que se disponga para el trasvase y con qué garantía" ni "si los requisitos de la Directiva de Hábitats, y en particular de sus artículos 6.3 y 6.4, se ha respetado". Para el departamento es "difícil entender" la afirmación de Madrid de que incluso dejando en el Ebro el máximo caudal ecológico barajado todavía hay un 86% de garantía del trasvase del Ebro.
