La importancia de Nayaf en el mundo shií tiene que ver con la presencia en la ciudad de la mezquita del imán Alí, pero también con acoger la sede de la Marjaya, un consejo que reúne a los más altos jerarcas del shiísmo en el mundo a los que se conoce como marjás. De los cuatro, el más influyente es el gran ayatolá Alí Sistani, nacido en Irán. Los otros son Mohamed Isaac al Fayad (Afganistán), Bashir al Najafi (Pakistán), y el iraquí Mohamed Said al Hakim.