El mayor éxito de Juan Antonio Bayona ha sido su última película Lo imposible, que cuenta con el aval de ser la película española más taquillera de la historia y la segunda más vista solo por detrás de Los otros, de Alejandro Amenábar. Dos meses después de su estreno en España ya había conseguido que acudieran a las salas de cine 5,6 millones de espectadores, siendo incluso más vista que Titanic en su época y convirtiéndose en la segunda película más taquillera en España (sólo tras Avatar con 52,2 millones de euros de recaudación y 6,2 millones de espectadores).Anteriormente, Bayona había debutado en la pantalla grande con El orfanato

. Este filme también tuvo éxito, tanto en taquilla como en crítica, en España y recaudó casi 80 millones de dólares de nivel mundial, estuvo nominada a 61 premios internaciones de los que ganó 31, entre los que destacan 7 premios Goya. Además, la empresa New Line Cinema compró los derechos para hacer un remake americano que estará también producido por Guillermo del Toro.