La Medalla de las Cortes es la distinción más elevada que otorga la institución. Su objetivo es recompensar a personas o entidades por la actividad que desarrollan, siempre que se centre en la defensa de los valores e identidad de Aragón. Entre los que han recibido este galardón figuran: Lorenzo Martín-Retortillo (2008), Mariano Moles Villamate (2009), Miguel Ángel Santos Gastón (2010), Antonio Angulo Araguás (2011) o la Facultad de Derecho (2012).